En fonction des caractéristiques des intrants que l’on souhaite méthaniser il existe plusieurs procédés :
Voie liquide ou infiniment mélangé
Le mélange des matières entrantes ne doit pas dépasser 15% de matière sèche
Le procédé est de type continue, c’est-à-dire que la quantité de matière entrante (intrant) est égale à la quantité de matière sortante (digestat).
Voie sèche
Le mélange des matières entrantes est généralement très supérieur à 15% de matière sèche. Le procédé peut être continu (type voie piston) ou discontinu (type voie garage ou silo)
La température
Il existe deux régimes de température en méthanisation :
Mésophile
Le substrat est à une température voisine de 38°C. Cela permet d’avoir un environnement propice au développement des différents micro-organismes participant à la méthanogénèse. Ce régime de température est très largement majoritaire sur les unités de méthanisation en France.
Thermophile
Le substrat est à une température voisine de 55°C. Les micro-organismes de la méthanogénèse sont différents de ceux qu’on retrouve en mésophile. L’augmentation de la température permet d’avoir une vitesse de dégradation de la matière plus rapide qu’en mésophile. Par contre, ce régime de température est moins résilient que l’autre à 38°C. La biologie en thermophile est plus difficile à maîtriser.